مشروع المكنون الميكروبي البشري Human Microbiome Project

مشروع تعاوني عالمي لمعرفة بايولوجية الإنسان وتفاعله مع الأحياء المرافقة له لإدامة صحته ، بدأ عام 2007 يهدف الى وضع المقاييس والأسس الأخلاقية والقانونية والاجتماعية وتأثيرها في مجال البحث في مكنون الإنسان الميكروبي فضلا عن البرامج والوسائل اللازمة للبحث . فمن المعروف ان البيئات المتطرفة مثل مبازل التعدين ألحامضي يقل فيها التنوع الميكروبي ولكن في بيئة مثل جسم الإنسان يزداد التنوع فيها توافقا مع البيئات الموضعية ، فالملاحظ ان القناة الهضمية تعج بالعديد من الأنواع والأعداد الميكروبية وينخفض هذا التنوع في منطقة المهبل لعدة اعتبارات . والاختلافات الكبيرة بين الأشخاص عقدت هذا المشروع ، ويهدف المشروع الى إيجاد المكنون الميكروبي المركزي Core Microbiome التي يشترك فيه الجميع ولكن الاختلافات الكبيرة لم تسمح بمثل هذا الاستنتاج مما أدى الى استعمال وحدات تصنيفية عالية أو الاعتماد على الجينات الفعالة بدلا من البحث عن الأحياء على مستوى النوع من التصنيف .
ولذلك كان من الضروري إجراء دراسات تربط بين البيئة والأحياء المجهرية والدراسات الجينومية وطرق حاسوب متقدمة وبمرافقة الدراسات المعتمدة على عمليات الزرع . ونتيجة كل هذه الدراسات تم الخلوص الى استبعاد وجود مكنون ميكروبي مركزي كبير على مستوى النوع ولكن قد تكون واردة على مستوى الشعب Phyla . ونظرالأهمية المكنون المركزي في تحديد حالة الصحة والمرض وعليه فاذا كان هناك ولو حد أدنى من المكنون المركزي أو عدم وجوده بالمرة فيجب استعمال استراتيجيات بديلة للدراسات لانه في كل مرة سيكون هناك جينات جديدة عند فحص شخص جديد .
وتستعمل طريقة تحديد تواليات 16S rRNA لدراسة وبائية الأمراض وكذلك الحساسية والسرطانات . ومجمل ما أشارت أليه الدراسات هو وجود حوالي 1800 جنس وعدد كبير من الأنواع وان أكثر مستوى تصنيفي يحصل فيه التغاير هو السلالات . ووجد ان 98 % من الأنواع تعود الى أربعة أقسام من البكتريا وهي (Firmicutes ( % 64 و Bacteroides  23 % و Proteobacteria % 8  و Actinobacteria % 3 .
وعلى العموم فان لهذا الاختلاف العديد من الأسباب . فمثلا في الأطفال بعمر من الولادة الى 2 سنة يتأثر مكنونهم الميكروبي بطريقة الولادة فيما اذا كانت طبيعية خلال المهبل أو بطريقة العمليات القيصرية ، وكذلك طريقة الرضاعة فيما اذا كانت طبيعية أي رضاعة الثدي أو رضاعة صناعية . وفلورا الأمعاء في المواليد تتمثل بالعصيات اللبنية والمكورات العنقودية والمكورات المسبحية وكذلك البكتريا المنشطرة Bifidobacteria .
وإضافة الى تأثير العمر فهنالك ظروف أخرى مؤثرة منها الغذاء ونمط الحياة والتوزيع الجغرافي أي ان هذه المجاميع الميكروبية تتشكل بناءا على الضغوط الانتخابية. ومن المعروف ان تحديد التواليات بالاعتماد على جينات 16S rRNA لا تعطي فكرة عن الوظائف ولكن دراسة جينوم المجتمع يكون وسيلة أو طريقة فعالة لتحليل وتجميع المعلومات حول الجينات الموجودة في المجتمعات الميكروبية وبما ان الكثافة التشفيرية للبكتريا عالية وتصل مستويات أعلى من 80 % لذلك فان التواليات Metagenomic Sequences التي يتم الحصول عليها لابد ان تحوي على مناطق مسئولة عن الوظائف . وقد أعلنت البيانات حول جينوم المجتمع او الجينوم البيئي  Metagenome  لمكنون الميكروبات للإنسان والفيران ، ووجد ان هنالك العديد من الجينات البكتيرية هي المسئولة عن وظائف لا يقوم بها الجينوم البشري وانما تقوم بها الفلورا منها ما يشارك في أيض الكلايكان Glycan أو الحوامض الامينية أو المواد الداخلية وكذلك تخليق بعض الفيتامينات والمواد الأخرى التي تكون مهمة في بايولوجية الإنسان ، وهذا ما يولد العلاقة الوثيقة بين الإنسان والفلورا التي يؤويها وان الموقف هو كائن خارق مكون من الإنسان والفلورا الميكروبية .