Low Complexity Regions

مناطق فيها تواليات متشابهة Homopolymeric Runs او ترادفات متكررة قد تكون ناتجة عن التمثيل المفرط لبعض الثمالات تظهر في التواليات ،يزيد ويرتبط بضراوة البكتريا الممرضة ووجودها في بعض الجينات ، وهناك برامج حاسوب يمكن ان تزيل هذه المناطق عند اجراء عمليات الاصطفاف Alignment ، منها SEG يستعمل لازالة تواليات الحوامض الامينية المتكررة من البروتينات ، وبرنامج DUST لازالة التواليات المتكررة من القواعدالنتروجينية في الحوامض الامينية . فضلا عن برنامج RepeatMasker ، وقد تكون عملية الحجب من النوع Soft Masking  او  Hard Masking  . وعماليات حذف هذه التواليات المربكة متوفرة في برنامج BLAST كاحد المؤشرات الاصيلة Default.