تؤكسد الجسيمات البيروكسية الأحماض الدهنية ذات السلاسل الطويلة جدا

يوجد في الجسيمات الصفرية شكلا معدلا من الأكسدة البتائية، وهو يؤدي إلى تشكيل الأسيتيل -CoA و H₂O₂ من خطوة نازعة الهيدروجين المرتبطة بالفلافوبروتين)، الذي يتم تحطيمه بوساطة الكاتالاز. لذلك فإن تفاعل نزع الهيدروجين هذا الذي يحدث في الجسيمات اليرووكسية يكون غير مرتبط بشكل مباش-ر بالفسفتة وبتوليد الـ ATP. وتكون الجملة متعلقة بالتتشيط الأولي بوساطة ستتاز أسيل -CoA ذي السلسلة الطويلة جدا وهي تسهل أكسدة الأحماض الدهنية ذات السلاسل الطويلة جدا (أي C20 و C22). وتتحرض هذه الإنزيمات بالأطعمة الفتية بالشحوم، وفي بعض الأنواع بالأدوية الخافضة لشحوم الدم مثل الكلوفيبرات.

ولا تقوم إنزيمات الجسمات البيووكسية بمهاجمة الأحماض الدهنية ذات السلاسل الأقصر؛ وبالمقابل تنتهي سلسلة تفاعلات الاكسدة البتائية عند إنتاج المركب أكتانويل -CoA. وتتم فيما بعد إزالة زمر الأكتانويل والأسيتيل من الجسمات البرروكسية على شكل أكتانويل كارنيتين وأسيتيل كارنيتين، اللذين يخضعان فيما بعد للأكسدة في المتقدرات. وتقوم الاكسدة البتائية الجارية في الجسيمات البيروكسية بدور إضافي هو تقصير السلسلة الجانبية للكوليسترول عتد تشكيل الأحماض الصفراوية. كما تشارك الجسيمات البيروكسية في تخليق إيثر الشحميات الجليسرولية  والكوليسترول والدوليكول. وتجدر الإشارة هنا إلى أن الجسيمات البيروكسية لا تحوي إنزيم ناقلة بلميتويل الكارنيتين.