هي بعض المواد غير البروتينية الثابتة تجاه الحرارة يطلق عليها المجاميع الرابطة أو المرافقات الإنزيمية الذي تكون في ارتباط قريب من الإنزيم وتساهم في عمل الإنزيم الجزء البروتيني من تلك الإنزيمات يعرف apoprotein وجزيئه الإنزيم المركبة تتألف من apoenzyme والمرافق الإنزيمي يطلق عليه الإنزيم الكامل holoenzyme المرافق الإنزيمي لا يتغير في نهاية التفاعل التحفيزي بعض الأحيان يمكن أن يتغير خلال التفاعل، إلا انه يعود إلى حالته الطبيعية بعد عدد من التفاعلات، مثال الشكل المؤكسد من المرافق الإنزيمي نيكوتين أميد أدنين ثنائي نيوكلوتيد NAD يختزل إلى NADH عندما بعمل كمرافق إنزيمي لإنزيمات dehydrogenase اللاهوائية إلا انه تعاد أكسدته إلى "NAD بوجود NADH-dehydrogenase في المايتوكوندريا ، المرافق الإنزيمي يتقبل مجموعة معينه ينتزعها من المادة الأساس بواسطة الإنزيم أو يهب مجموعه معينة يضيفها إلى المادة الأساس بواسطة الإنزيم، بعض الأحيان تكون المرافقات الإنزيمية معقدات وسطية مع المواد الأساس فعلى سبيل المثال فإن المرافق الإنزيمي بيريدوكسال فوسفيت لإنزيم amino transferase تكون قاعدة شيف كمركب وسطي مع الأحماض الأمينية (الجدول -3). جدول (3) بعض المرافقات الأنزيمية

بعض المعادن يمكن أن تكون جزء أساسي من المجموعة الرابطة مثل الزنك في carbonic anhydrase أو النحاس في ascorbic acid oxidase أو المغنيسيوم transketolase, enolase أو الحديديك معقد بروتين كبريت- حديد) في adrenotropic و ferredoxin أو المولبيدنم أو الحديد أو الكبريت في molybdo ferredoxin ، المواقع الفعالة لبعض الإنزيمات يمكن أن تحتوي أيونات معدنية مثل المغنيسيوم في إنزيم الماليك و isocitrate dehydrogenase، في بعض الحالات وحتى في المستحضرات الإنزيمية ذات النقاوة العالية تحتوي أيونات معدنية، فأن نزعها يسبب فقد في نشاط الإنزيم أحيانا الأيونات أحادية الشحنة الموجبة مثل أيون الصوديوم والبوتاسيوم تحتاج تلك الأيونات للمحافظة على هيئتها الصحيحة للإنزيم، طبقا لفرضية فشر، فإن المرافقات الإنزيمية تمتص أو ترتبط أولا على apoenzyme مما يسهل ذلك ارتباط المادة الأساس إلى الإنزيم.