إن ارتباط المادة الأساس مع الحامض الأميني الرابط في الإنزيم يحتاج وجود مجاميع خاصة على المادة الأساس أو هيئات خاصة من جزيئة المادة الأساس مما يجعل الإنزيم يرتبط مع أو يعمل على عدد محدود من المواد الأساس التي تملك تخصصات لازمة، التخصص للمادة الأساس يعتمد على الأحماض الأمينية أو مجاميع أخرى مثل الأيونات المعدنية في الموقع الفعال من الإنزيم وعلى الهيئة الخاصة في جزيئه الإنزيم، بعض الإنزيمات تبين تخصص المجموعة group specificity الذي يعمل فقط على أنواع معينه من الروابط أو المجاميع الكيمياوية في المواد الأساس ولا يعمل على المواد الأساس الخاصة منها، بعض الأحيان تخصص المجموعة يكون معقد ، فأن الإنزيم يعمل على نوع معين من الروابط عندما الروابط ترتبط مع مجموعة معينه أو سلاسل جانبية في المادة الأساس وعلى سبيل المثال فان التربسين في العصير البنكرياسي يحلل الروابط الببتيدية المرتبطة إلى مجاميع الكربوكسيل في الأحماض الامينية القاعدية مثل الارجنين واللايسين، إن leucine aminopeptidase في العصير المعوي يحلل الأواصر الببتيدية الطرفية المرتبطة إلى اللايسين في الطرف النتروجيني من الببتيد ، بعض الإنزيمات قلك أنواع مختلفة من التخصص المجسم stereospecificity بينما البعض الآخر يسلك تخصص ضوئي optical specificity الذي يحلل التغير فقط في مناظر ضوئي واحد من المادة الأساس بدون التأثير على المناظر الآخر، D-amino acid oxidase L-amino acid oxidase في كبد وكلى اللبائن لا تظهر تخصص في العمل على المتناظرات DL من الأحماض الأمينية، بعض الإنزيمات مثل fumarase ملك تخصص هندسي geometric specificity من نوع Cis أو Trans ويعمل بصورة خاصة إما على الشكل Cis أو الشكل Trans من المادة الأساس لكن ليست على كليهما.