تتولد قوة طرد مركزية أثناء دوران الشيء حول المحور المركزي لآلة الطرد المركزي فلو كان الشيء هذا جزيئة أو دقائق لها وزن جزيئي فأن :

إذ تمثل: F = قوة الطرد المركزي Centrifugal Force أو القوة الأرضية Gravitational force).

ω² = السرعة الدورانية ( تعبر بدورة لكل دقيقة (rpm) Round per minute ) .

r = محور الدوران (مسافة نصف القطر من مركز الدوران في جهاز الطرد  المركزي  ) .

إن الفصل في حالة استخدام قوة الطرد المركزي يتم اعتماداً على كتلة المادة Mass وليس شكلها أو شحنتها. تستخدم في بعض الأحيان أنواع من الأجهزة تسمى أجهزة الطرد المركزي ذات السرعة العاليـة Ultracentrifugation وذلك عند استخدام سرع أعلى من 10000 دورة لكل دقيقة. ان أجهزة الطرد المركزي ذات السرعة العالية تتولد عنها درجات حرارة عالية قد تؤثر على المركب المراد فصله ولذلك يجب ان يتوفر شرطان في الجهاز وهما:

1- التبريد Refrigerator ، للتقليل من الحرارة الناتجة عن السرعة العالية.

2- انخفاض في الضغط اقل من الضغط الجوي للتقليل من الاحتكاك مع الهواء باستخدام جهاز مفرغ الضغط Vacuum Pump.

ان الوحدات المستخدمة في الجهاز هي دورة لكل دقيقة (Round per mint (rpm أو استخدام وحـــدة التعجيل الأرضي (g Gravitational force) أي تنسب قوة ترسيب المادة الى التعجيل الأرضي وتستخرج من المعادلة السابقة بعد تحديد عدد الدورات في الدقيقة rpm ونصف قطر محور الدوران لجهاز الطرد المركزي.

يرجى ملاحظة إذا كان القياس بوحدة rpm فيجب ذكر نصف قطر القرص المستخدم في جهاز الطـــرد المركزي بسبب وجود عدة أنواع منها (3 سم و 5 سم و 7 سم (وأن الدورة عندما تكون صغيرة تختلف عـــن الدورة إذا كانت كبيرة من ناحية توليدها لقوة الطرد المركزي لذا يفضل دائماً استخدام قيمة g (باعتبارها قيمة ثابتة) من اجل عدم ذكر قيمة وحدة القرص المستخدم في الجهاز وهناك ثلاثة أنواع من الدوران فـــي الجهاز (الشكل 19-13) :

1- ثابت زاوية الدوران Fixed angle rotation بزاوية قدرها 14 درجة.

2 معلق Swinging bucket بشكل أفقي ثابت عند الدوران. 3- عمودي Vertical.

إذ تترسب الجزيئات في محاليلها عند استعمال قوة الطرد المركزي وتعتمد سرعة الترسيب على:

 أ- صفات الجزيئات المترسبة وتتضمن : الحجم والكتلة وكثافة الجسم.

ب- صفات المذيب ومنها: الكثافة واللزوجة.

ج- القوة المستعملة في عملية الطرد المركزي.

تستخدم طريقة الطرد المركزي على نطاق واسع في التنقية لفصل إنزيم من آخر وخاصة إذا كانت الأحجام المستخدمة قليلة (بضعة سنتمترات). أما إزالة الرواسب والمواد الصلبة كما هو الحال عند إزالة بقايا الخلايا بعد التجنيس Homogenization أو تجميع الإنزيم الذي يترسب بإضافة كبريتات الأمونيوم فيتم ذلك باستخدام جهاز الطرد المركزي عند سرعات منخفضة في حدود 5000 الى 10000 دورة لكل دقيقة حيث وجد أن هذه السرعات هي المناسبة في هذه الحالة.