التخمر الميكروبي في الأمعاء الغليظة 

تحتوي الأمعاء الغليظة (مقارنة ببقية القناة الهضمية) على أنواع مختلفة من الكائنات الحية الدقيقة وبأعداد متباينة حيث يصل عددها إلى أكثر من 400 نوع في الحيوانات آكلة العشب (جدول 1). وهي الموقع المناسب لإتمام عملية التخمر الميكروبي للمواد السليلوزية التي يتناولها الحيوان والتي تسفر عن إنتاج الأحماض الدهنية المتطايرة Volatile Fatty Acid, VFA وهي حامض الخليك Acetic Acid، وحامض البروبينيك Propionic Acid وحامض البيوتريك Butyric Acid بالإضافة إلى حامض اللاكتيك Lactic Acid وغاز الميثان (CH4) والهيدروجين وثاني اكسيد الكربون. يتم امتصاص هذه النواتج من الخلايا المعوية وما تبقى يتم طرده إلى الخارج في صورة براز او غازات.

جدول 1: عدد الكائنات الحية الدقيقة في القناة الهضمية

تعتبر نواتج الهضم الميكروبي عناصر أساسية وضرورية لحياة الحيوانات آكلة العشب ولكن فائدتها تظل محدودة جداً بالنسبة للحيوانات الأخرى كالإنسان والكلاب والقطط عدا أنها تساعد في امتصاص الماء وفي هضم السكريات التي لم تهضم في الأمعاء الدقيقة وكذلك تصنيع فيتامين (ك) وعدد من فيتامينات (ب).