البروتينات الدهنية والبروتينات المعدنية 

البروتينات الدهنية Lipoproteins

تدخل الدهون في التركيب الابتدائي لهذا النوع من البروتينات، وهي توجد في مصل الدم والأنسجة الدماغية والبيض، وقد أشرنا الى هذا النوع من المركبات البروتينية في فصل اللبيدات.

البروتينات المعدنية Metaloproteins

يدخل في تركيب هذا النوع من البروتينات بعض المعادن مثل الحديد، والنحاس، والمغنيسيوم، مكا في جزيئة الفرتين (Ferritin) والهيموكلوبين (Haemoglobin). كما يمكن اعتماد مبدأ آخر في تصنيف المركبات البروتينية، وهو مبدأ الوظائف الحيوية التي تقوم بها الجزيئات البروتينية في الخلية الحية فالأنزيمات، والبروتينات الخازنة، والناقلة، والهورمونات، والبروتينات، المتقلصة والوقائية، والبروتينات التركيبية، والسموم، ما هي إلا أمثلة على تصنيف البروتينات وفق وظائفها الفسيولوجية.

تعتبر الأنزيمات من أهم وأكبر أصناف البروتينات وتقوم هذه المركبات بمهمة تسريع وتعجيل ومساعدة العديد من التفاعلات التي تجري داخل خلايا وأنسجة الكائنات الحية. اما البروتينات الخازنة مثل زلال البيض، فإنها تقوم بخزن ونقل العديد من الاحماض الامينية، وهنالك نوع آخر من البروتينات يقوم بنقل الدهون عن طريق الدم مثل البروتينات الدهنية. وتعتبر جزيئة الهيموكلوبين من البروتينات الناقلة، اذ تقوم بنقل الأوكسجين من الرئتين الى بقية انحاء الجسم. وهنالك صنف من البروتينات يقوم بتنظيم التفاعلات الحيوية مثل الهورمونات.