تلاحظ ظاهرة الوقاية المتبادلة عند العدوى المتتالية للنبات العائل بسلالة أو بأخرى من نفس الفيروس. لو أعديت نباتات الدخان بسلالة من فيروس موزايك الدخان ثم بعد مرور بعض الوقت عندما يصبح المرض جهازيا تعدى النباتات بسلالة أخرى من نفس الفيروس فإن السلالة الأخيرة يضعف تكاثرها أو قد لا تتكاثر إطلاقا، ويصعب ملاحظتها في أنسجة النبات، وبالتالي فإن الاصابة سلالة فيروسية تحمي النبات من الاصابة بسلالة أخرى من نفس نوع الفيروس.

وجد ماکيني عام ۱۹۲۹ Mckinney أن نباتات الدخان المصابة بسلالة الموزايك الأخضر لفيروس موزايك الدخان لم يظهر عليها أعراضا أخرى إضافية عند عدواها بسلالة الموازيك الأصفر لنفس الفيروس. وقد وجد سالامان عام ۱۹۳۳ Salaman ان نباتات الدخان المصابة بسلالة ضعيفة من فيروس × البطاطس كانت منيعة ضد الاصابة بسلالة أخرى شديدة من نفس الفيروس.

ويطلق على تلك الظاهرة اسماء مختلفة منها الوقاية المتبادلة cross protection التضاد antagonism أو عدم التوافق interference.

إن اختبارات الوقاية المتبادلة لمدة طويلة كان لها أهمية كبرى لمعرفة إذا ما كان عزلتين فيروسيتين عبارة عن سلالتين متقاربتين لنفس الفيروس ام لا إلى أن اظهرت نتائج الأبحاث أن تلك الظاهرة لا يمكن تعميمها على كل الفيروسات. فقد تظهر سلالات فيروس ما وقاية متبادلة بينما سلالات فيروس آخر قد تظهر وقاية جزئية او لا تظهر وقاية إطلاقا. فلا توجد درجة عالية من الوقاية بين سلالات فيروس موزايك الدخان أو بين سلالات فيروس موزايك الخيار أو بين سلالات فيروس التبقع الحلق في الدعان. أما بالنسبة لفيروس x البطاطس مثلا فبعض سلالاته قد تظهر وقاية متبادلة، بينما البعض الآخر يعطى وقاية جزئية والبعض الثالث لا يتميز بهذه الظاهرة. كما أن معظم سلالات فيروس تجمد قمة بنجر السكر لا تتميز ايضا بهذه الظاهرة.

تدل الظواهر في معظم الحالات على وجود علاقة بين درجة الوقاية المتبادلة ودرجة القرابة السيرولوجية. الوقاية المتبادلة تكون كاملة بين السلالات المتقاربة جدة، بينما بين السلالات ذات القرابة البعيدة نسبيا تكون غير كاملة.

تتأثر درجة الوقاية المتبادلة بالعوامل الآتية:

1- الفترة بين العدوى الأولى والثانية:

درجة الوقاية قد تتأثر بالمدة بين العدوى بالسلالة الأولى والسلالة الثانية، باستخدام سلالتي X^H , X^G لفيروس X البطاطس لحماية نباتات الدخان من الاصابة بخمس سلالات أخرى شديدة العدوى من نفس الفيروس وجد أن النتائج المتحصل عليها تتباDن وتختلف عندما تكون المدة 5 أيام. بزيادة المدة تزداد درجة الوقاية وعندما تكون المدة 8 أيام فإن الوقاية تكون كاملة.

2- عمر وحالة النبات:

يحدد عمر وحالة النبات بدرجة كبيرة، سرعة انتشار الفيروس خلال الأنسجة المختلفة. إذا كان نمو النبات ضعيفا نتيجة لعدم ملاءمة الظروف البيئية فإن سرعة تكاثر الفيروس تقل وبالتالي فإن حماية النبات من الاصابة بالسلالة الشديدة قد تكون غير كاملة.

3- نوع النبات:

بعض السلالات الضعيفة من فيروس موزايك الدخان تحمى نباتات Nicotiana sylvestris من العدوى بسلالة موزايك أوكيوبا aucuba mosaic ولكنها تعطى وقاية جزئية إذا ما استخدمت بعض أنواع الدخان الأخرى. كما وجد أيضا أن ، سلالات ضعيفة من فيروس x البطاطس تظهر وقاية كاملة في نباتات Datura stramonium ولكنها لا تظهر تلك الوقاية في نباتات D. metal

4- كمية اللقاح:

عدوى النباتات المصابة بسلالة فيروسية ضعيفة بلقاح يحتوي على تركيز عالي من سلالة أخرى لنفس الفيروس قد يقلل من درجة الوقاية. استخدام لقاح يحتوي على تركيز عالي من فيروس موزايك الاكيوبا (يعطي بقع ميتة على N. sylvestris ) يؤدى إلى ظهور بقع ميتة على أوراق N. sylvestris المصابة بسلالة الفيروس الضعيفة التي تعطي أعراض موزايك، ولكن البقع في تلك الحالة تظهر في المناطق الخضراء من الورقة حيث تركيز فيروس السلالة الضعيفة يكون منخفضا جدا.

لا يوجد في الوقت الحالي معلومات كافية عن كيفية تفاعل السلالات داخل الخلايا وبالتالي كيفية حدوث الوقاية المتبادلة. وقاية أو مقاومة النبات ضد الاصابة بسلالة أخرى من نفس الفيروس تتم عندما تكون السلالة الأولى موجودة في معظم انسجة النبات (تعطى أعراضا جهازية). إذا ظلت لأي سبب من الأسباب بعض أجزاء النبات خالية من السلالة الأولى فان تلك الأجزاء تصاب اثناء العدوى التالية بنفس السلالة الفيروسية أو بسلالات أخرى من نفس الفيروس. يطلق على المقاومة التي يكتسبها النبات بهذه الطريقة المقاومة المكتسبة غير النقية monsterile acquired resistance وذلك للتفريق بينها وبين نوع آخر من المقاومة يطلق عليه المقاومة المكتسبة النقية sterile acquired resistance.