أقرأ أيضاً
التاريخ: 28-9-2019
2677
التاريخ: 9-12-2015
2495
التاريخ: 14-4-2021
1326
التاريخ: 18-11-2020
1908
|
الأطلس BLAST Atlas
اطالس تعتمد على نتائج برنامج BLAST لإجراء المقارنات وذلك لربط برامج رسم الأطالس مع BLAST لتحقيق هذا الغرض . ويمكن بواسطة هذا البرنامج وضع خرائط للحوامض الامينية والنيوكلوتيدات التي تشفر لها بعد الربط بالبرامج الخاصة بها مثل BLASTn للنيوكلوتيدات او BLASTp للبروتينات او غيرها من إصدارات برنامج BLAST وفق الغرض المطلوب . والبرنامج يمكن ان يربط مع ACT لمقارنة 2 او أكثر من الجينومات ، وتتفق وسائل رسم أطالس المقارنة بوجود جينوم مرجعي وبذلك يمكن تحديد الجينوم الشامل والجينوم المركزي . وفي هذا النوع منالأطالس يتم تحديد التطابقات Matches ودرجاتها بالاعتماد على الشفرات اللونية التي تستعمل نظام RGB (نظام Red, Green , Blue في التلوين ) على مقياس 0 - 10 وتكون القيم المتوسطة بلون رمادي فاتح . وفيمثل هذه البرامج يمكن التحكم بالصفات المراد دراستها بما توفره في خيارات مثل نوعية جزيئة DNA هل هي حلقية ام مفتوحة واطر القراءة المفتوحة ومتجاورات الكروموسوم وصفات أخرى على ان تكون متوفرة في الجينوم المرجعي لذلك يكون من الأفضل استعمال اكبر جينوم موجود كمرجع وكلها تجمع وتعالج بالبرنامج دون الحاجة الى تدخل المستخدم . بعض أطالس تكون بشكل دوائر متحدة المركز ) في اغلب الأحيان ووفق الطلب ( ومعها المؤشرات المستعملة . وفي الوقت الحاضر توفر هذه الوسائل مقارنة عشرات الجينومات ولكن الطموح الى المئات والآلاف من التواليات قائما" . ويمكن استعمال مثل هذه الأطالس لرسم أطالس الجينومات البيئية ورسم الجينات بغض النظر عن اصوالها بالاستناد الى جينوم مرجعي والشكل التالي يوضح احد هذه الأطالس باستعمال جينوم Pelotomaculum thermopropionicum كمرجع لانه من الجينومات الكبيرة .
ونظرا" لكثرة الجينومات المستعملة فضلا" عن قلة التطابقات ( BLAST Hits) الموجودة في النماذج البيئية يلاحظ ان الألوان تكون باهتة . ويظهر الشكل مقارنة 31 نوع من أجناس بكتيرية مختلفة .
|
|
اكتشاف تأثير صحي مزدوج لتلوث الهواء على البالغين في منتصف العمر
|
|
|
|
|
زهور برية شائعة لتر ميم الأعصاب التالفة
|
|
|
|
جمعيّة العميد وقسم الشؤون الفكريّة تدعوان الباحثين للمشاركة في الملتقى العلمي الوطني الأوّل
|
|
الأمين العام المساعد لجامعة الدول العربية السابق: جناح جمعية العميد في معرض تونس ثمين بإصداراته
|
|
المجمع العلمي يستأنف فعاليات محفل منابر النور في واسط
|
|
برعاية العتبة العباسيّة المقدّسة فرقة العبّاس (عليه السلام) تُقيم معرضًا يوثّق انتصاراتها في قرية البشير بمحافظة كركوك
|