من أهم الأمراض التي تصيب الباذنجان ما يلي:

الذبول الطري Damping off ، وتسببه الفطريات Pythium spp . ، Rhizoctonia solani ، . Phytophthora spp

لفحة ألترناریا Alternaria Blight ، ويسببها الفطر Alternaria solani .

البياض الدقيقي powdery Mildew ، ويسببه الفطر Leveillula taurica.

الذبول الفيوزاري Fusarium wilt، ويسببه الفطر Fusarium annuum.

لفحة اسكليروشيم Sclerotium Blight، ويسببها الفطر Sclerotium rolfsii.

لفحة فوموبسس Phomopsis Blight، ويسببها الفطر Phomopsis vexans.

الذبول البكتيري Bacterial Blight، وتسببه البكتيريا Pseudomonas solanacearum.

نيماتودا تعقد الجذور Meloidogyne spp.) Root Knot Nematodes).

كما يصاب الباذنجان كذلك بحفار ساق الباذنجان، ودودة درنات البطاطس، ودودة ورق القطن، والدودة الخضراء، والذبابة البيضاء، والمن، ونطاطات الأوراق، والعنكبوت الأحمر.