تحد الروابط الببتيدية من عدد الهيئات الثانوية المحتملة

يكون الدوران ممكناً فقط حول اثنتين من الروابط الثلاثة التساهمية التي تشكل الهيكل الأساسي لعديد الببتيد في البروتينات. وتعمل خاصية الرابطة المزدوجة الجزئية للرابطة التي تصل بين كربون الكربونيل والنتروجين ألفا للرابطة الببتيدية على الحد بشكل واضح من عدد الهيئات المحتملة للذرات المرتبطة بها والتي تصبح في مستوى واحد (Coplanar). ويكون الدوران الحر ممكناً فقط حول الروابط التي تربط الكربون ألفا (C α) إلى كربون الكربونيل (Co) والنتروجين. وتدعى الزاوية حول الرابطة Ca - N بالزاوية فاي (phi .Φ) والزاوية حول الرابطة Cα - Co بالزاوية ساي (’psi ،Ψ) ، ولا يسمح باجتماع زاويتي فاي وساي الذي يؤدي إلى إعاقة فراغية بين الذرات غير المرتبطة. وعندما تعرف كل الزوايا فاي وساي، يمكن معرفة هيئة كل ذرات السلسلة الأساسية أو هيكل عديد الببتيد اًلاساسي؛ ولذلك يبدأ تحليل معلومات تصويراليلودكت بتحديد الزوايا فاي وساي للسلاسل الأساسية. وقد اً ستخدم راماشاندران G.N. Ramachandran) مخططاً بيانياً لزوليا فاي مقابل زوايا ساي لتبيان كل من القيم السموح بها والقيم العديدة غير المسموحة (الشكل 26).

الشكل 2-6 مخطط راماشرندرلن للزوايا فاي   وساي ... للسلسلة الاساسية لحوالي 1000 من الثمالات غير الجليسين في ثمانية بروتينات جرى تحليل بنيتها بميز عال. وتشير النقاط الى نماذج الاتحاد الممكنة وتشير المسافات الى نماذج الاتحاد غير الممكنة للزوايا فاي وساي

مواضيع ذات صلة

محلل الأحماض الأمينية التلقائي Automated amino acid analyzer

تقدير الوزن الجزيئي للبروتينات

استخلاص وتنقية البروتينات Isolation and purification of proteins

الكالموديولين Calmodulin

الكارنيتين Carnitine

حامض الليبويك Lipoic acid

حامض البانتوثينك Pantothenic acid

حامض الفوليك Folic acid (الفولاسين Folacin)

تراكيب الأحماض النووية

تقدير البروتين Protein determination

تغيير الحالة الطبيعية للبروتين (المسخ) Denaturation

ذوبانية البروتينات Solubility of proteins