قامت الشرطة بدورها في التحقيق في سبب وفاة الامام و قد بذلت قصارى جهودها في ان الامام مات حتف أنفه لتبرى‏ء ساحة الطاغية هارون و قد قام بذلك السندي ابن شاهك و كان ذلك في مواضع منها ما رواه عمرو بن واقد قال: ارسل إليّ السندي بن شاهك في بعض الليل و أنا ببغداد فخشيت ان يكون لسوء يريده بي فأوصيت عيالي بما احتجت إليه و قلت: إنا للّه و إنا إليه راجعون ؛ ثم ركبت إليه فلما رآني مقبلا قال: يا أبا حفص لعلنا أرعبناك و ازعجناك؟ ..

- نعم ..

- ليس هنا الا الخير ....

- فرسول تبعثه الى منزلي ليخبرهم خبري ..

- نعم ..

و لما هدأ روعه و ذهب عنه الخوف قال له السندي: يا أبا حفص أ تدري لم أرسلت إليك؟ ...

- لا ..

- ا تعرف موسى بن جعفر؟ ..

- أي و اللّه أعرفه و بيني و بينه صداقة منذ دهر ..

- هل ببغداد ممن يقبل قوله تعرفه أنه يعرفه؟ ...

- نعم ؛ ثم انه سمى له اشخاصا ممن يعرفون الامام فبعث خلفهم فقال لهم: هل تعرفون قوما يعرفون موسى بن جعفر؟ فسموا له قوما فأحضرهم و قد استوعب الليل فعله حتى انبلج نور الصبح و لما كمل عنده من الشهود نيف و خمسون رجلا امر بإحضار كاتبه و يعرف اليوم بكاتب الضبط فأخذ في تسجيل اسمائهم و منازلهم و اعمالهم و صفاتهم و بعد انتهائه من الضبط اخبر السندي بذلك فخرج من محله و التفت الى عمرو فقال له: قم يا أبا حفص فاكشف الثوب عن وجه موسى بن جعفر فكشف عمرو الثوب عن وجه الامام و التفت السندي الى الجماعة فقال لهم: انظروا إليه فدنا واحد منهم بعد واحد فنظروا إليه جميعا ثم قال لهم: تشهدون كلكم أن هذا موسى بن جعفر؟ ...

- نعم ؛ ثم أمر غلامه بتجريد الامام من ملابسه ففعل الغلام ذلك ثم التفت الى القوم فقال لهم:

أ ترون به أثرا تنكرونه؟ ..

فقالوا: لا.

ثم سجل شهادتهم و انصرفوا ؛ كما استدعى فقهاء بغداد و وجوهها و فيهم الهيثم بن عدي فسجل شهادتهم بان الامام مات حتف انفه‏ و فعل هارون مثل ذلك من الاجراءات و السبب في ذلك تنزيهه من اقتراف الجريمة و نفي المسؤولية عنه.