بطارية الليثيوم أيون غير مستقرة مثل بطاريات هيدريد معدن النيكل أو تصاميم بطاريات النيكل كادميوم، وقد تكون خطرة إلى أبعد الحدود إذا جرى التعامل معها بشكل سيئ. فهي قد تنفجر explode إذا ما سخنت بدرج كبيرة أو إذا شحنت من خلال فولتية عالية. بالإضافة إلى إنها قد تتلف إذا جرى تفريغها إلى أقل من فولتية معينة . لتقليل هذه المخاطر فإن بطارية الليثيوم أيون تحتوي بشكل عام على دائرة صغيرة تطفئ البطارية عند التفريغ إلى أقل من فولتية معينة ( نموذجيا3V )وتشحن إلى فوق حد معين نموذجيا   4.27V.

هذه الدائرة تمنع التفريغ الشديد للبطارية في الاستخدام العادي وعلى أي حال عند خزن البطارية لفترة طويلة، فإن التيار القليل المسحوب من قبل دائرة الحماية قد يتسبب في تفريغ البطارية بشدة deeply drain . بعض التطبيقات applications معدة لعلاج البطاريات ذات التفريغ الشديد من خلال إعادة الشحن بشكل بطيء أيضاً، بالإضافة إلى ذلك فإن مثل هذه الدوائر ترفع سعر بطاريات الليثيوم أيون والتي هي أكثر من القيمة المقارنة لبطاريات NiMH أو NiCD.