من المهم أن نعلم أن الكفاءة الكروماتوغرافية هي مقياس لمدى احتجاز المادة في الوسط الساكن ومقارنتها بعرض المنحنى W.

وتُعَدُّ الكفاءة مفيدة في حالة مقارنة عمليات الفصل الكروماتوغرافي تحت تأثير ظروف مختلفة.

إن معامل الكفاءة يسمى عادة بعدد الطبقات النظرية N التي من مجموعها يتكون عمود الفصل، حيث إنه في كل طبقة من هذه الطبقات تحدث عملية اتزان للمادة المراد تحليلها بين الوسط الساكن والوسط المتحرك. وعلى هذا الأساس كلما زاد عدد الطبقات في العمود كانت عملية الفصل أفضل، وبدل استخدام N للدلالة على كفاءة عملية الفصل يمكن استخدام سمك الطبيقة النظرية H .

وكلما كانت قيمة H منخفضة فمعنى هذا أن المادة تصل بسرعة إلى حالة الاتزان ومن ثُمَّ تخرج من العمود منفصلة وبسرعة.