رغم التشابه بين النمطين الا ان الاختلاف بينهما يأتي في النقاط التالية:

1. ان التحقيق يتناول قضية او مشكلة (البطالة، رغيف الخبز، اسعار الدواء، الامراض المتوطنة) اما التقرير الصحفي فهو يتناول خبراً او موضوعاً يثير اهتمام الجمهور عن طريق نشر المزيد من المعلومات والآراء عن الموضوع المثار.
2. في التحقيق الصحفي يقوم المحرر بعرض وجهات النظر في القضية المطروحة من خلال التحقيق، وبالتالي فلا يسمح له بالتعبير عن وجهة نظره، او تأييد رأي آخر، بينما التقرير الصحفي تظهر من خلاله شخصية الكاتب ووجهة نظره، فضلا عن كونه ليس مضطراً لأن يكون التقرير متفقاً وسياسة التحرير التي تقوم عليها الصحيفة التي يعمل بها.