المرجع الالكتروني للمعلوماتية
المرجع الألكتروني للمعلوماتية
آخر المواضيع المضافة
Untitled Document
أبحث عن شيء أخر المرجع الالكتروني للمعلوماتية

علي عليه السلام في نظر العظماء والأعداء
4-3-2018
Mitochondrial Inheritance
7-3-2019
Yeast Centromer Vector
30-9-2020
Link Diagram
27-6-2021
دلائل الباقر (عليه السلام) لجابر الجعفي
15-04-2015
المنهج الإحصائي
7-2-2022


الأطلس BLAST Atlas


  

1421       02:29 مساءً       التاريخ: 12-6-2018              المصدر: زهرة محمود الخفاجي

أقرأ أيضاً
التاريخ: 2025-01-05 372
التاريخ: 1-12-2015 2888
التاريخ: 8-12-2015 2249
التاريخ: 21-11-2020 2975
التاريخ: 1-1-2016 2269
الأطلس BLAST Atlas

اطالس تعتمد على نتائج برنامج BLAST لإجراء المقارنات وذلك لربط برامج رسم الأطالس مع BLAST لتحقيق هذا الغرض . ويمكن بواسطة هذا البرنامج وضع خرائط للحوامض الامينية والنيوكلوتيدات التي  تشفر لها بعد الربط بالبرامج الخاصة بها مثل BLASTn للنيوكلوتيدات او BLASTp للبروتينات او غيرها من إصدارات برنامج BLAST وفق الغرض المطلوب . والبرنامج يمكن ان يربط مع ACT لمقارنة  2 او أكثر من الجينومات ، وتتفق وسائل رسم أطالس المقارنة بوجود جينوم مرجعي وبذلك يمكن تحديد الجينوم الشامل  والجينوم المركزي . وفي هذا النوع منالأطالس يتم تحديد التطابقات Matches ودرجاتها بالاعتماد على الشفرات اللونية التي تستعمل نظام RGB (نظام Red, Green , Blue في التلوين ) على مقياس 0 - 10 وتكون القيم المتوسطة بلون رمادي فاتح . وفيمثل هذه البرامج يمكن التحكم بالصفات المراد دراستها بما توفره في خيارات مثل نوعية جزيئة DNA هل هي حلقية ام مفتوحة واطر القراءة المفتوحة ومتجاورات الكروموسوم وصفات أخرى على ان تكون متوفرة في الجينوم المرجعي لذلك يكون من الأفضل استعمال اكبر جينوم موجود كمرجع وكلها تجمع وتعالج بالبرنامج دون الحاجة الى تدخل المستخدم . بعض أطالس تكون بشكل دوائر متحدة المركز ) في اغلب الأحيان ووفق الطلب ( ومعها المؤشرات المستعملة . وفي الوقت الحاضر توفر هذه الوسائل مقارنة عشرات الجينومات ولكن الطموح الى المئات والآلاف من التواليات قائما" . ويمكن استعمال مثل هذه الأطالس لرسم أطالس الجينومات البيئية  ورسم الجينات بغض النظر عن اصوالها بالاستناد الى جينوم مرجعي والشكل التالي يوضح احد هذه الأطالس باستعمال جينوم Pelotomaculum thermopropionicum كمرجع لانه من الجينومات الكبيرة .
src=../../../medea/images/1_1818.jpg
ونظرا" لكثرة الجينومات المستعملة فضلا" عن قلة التطابقات ( BLAST Hits) الموجودة في النماذج البيئية يلاحظ ان الألوان تكون باهتة . ويظهر الشكل مقارنة 31 نوع من أجناس بكتيرية مختلفة .


Untitled Document
د. فاضل حسن شريف
تفاسير القرآن الكريم عن الأم (ح 2) (أمه)
السيد رياض الفاضلي
لا مقارنة بين الذكاء البشري وغيره
جواد مرتضى
الحسين ملاذ الخائفين
د. فاضل حسن شريف
کتاب الإمام الصادق عليه السلام للشيخ المظفر والقرآن...
جواد مرتضى
شرح زيارة الامام الحسين في ليلة النصف من شهر شعبان
علاء كاظم عثمان الذرب ال ازيرج
الطلاق في المجتمع العراقي: بين الأسباب الاجتماعية...
زيد علي كريم الكفلي
وقت الغروب شموع متوقدة في شريعة الكفل
السيد رياض الفاضلي
دعوة صادقة
محمد الموسوي
المضادات الحيوية سلاحٌ ذو حدين
علي الفتلاوي
تآكل التربة
د. فاضل حسن شريف
اشارات قرآنية من کتاب الرسول الأعظم على لسان الإمام...
السيد رياض الفاضلي
عظمة أهل البيت (عليهم السلام) وحدود القياس بهم
د. فاضل حسن شريف
اشارات قرآنية من کتاب الرسول الأعظم على لسان الإمام...
د. فاضل حسن شريف
اشارات قرآنية من كتاب فقه الإمام الصادق للشيخ مغنية (ح...