أقرأ أيضاً
التاريخ: 27-7-2017
1627
التاريخ: 21-8-2017
1693
التاريخ: 16-9-2019
1627
التاريخ: 24-6-2021
1238
|
FASTA
حزمة FASTA Package) FASTA ) والاسم مأخوذ من ( Fast for All ) تشبه حزمة برامج BLAST مكونة من عدة برامج منها FASTAN للبحث عن تشابه التواليات مقابل قواعد النيوكلوتيدات وبرنامج EASTAP للبحث عن تشابه التواليات مقابل قواعد بيانات البروتينات وتوجد مواقع مزودة للحزمة للبحث عن تغايرات النيوكلوتيد المفرد SNP وآخر خاص بمكنون البروتين والعمليات الخاصة بالخياطة البديلة وآخر خاص بالجينومات وكثيرة غيرها.
وتحدد الأهمية الإحصائية لنتائج FASTA بعدد من القيم منها قيمة E ودرجة الشكم وهي مشابهة لما في برنامج BLAST ، وهناك قيمة أخرى تستخدم في هذا البرنامج وهي قيمة Z وهي قيمة معيارية توضح الأهمية الإحصائية لمدى اصطفاف توالي الاستعلام Query Sequence مع تواليات قواعد البيانات البعيدة عنها، والقيم المرتفعة لل Z تعني معنوية أعلى لتطابق التواليين، فاذا كانت درجة Z اكبر من 15 دل ذلك على ان هناك تطابق معنوي كبير مع علاقة تماثل جذري Homology ، اما القيم بالمدى 5 - 15 دل ذلك على احتمالية وجود تماثل جذري عالي والقيم اقل من 5 فتشير الى علاقات ضعيفة.
ونتائج البرنامج يمكن ان تكون على شكل تقرير مصور يعتمد الألوان في تفسير وتحديد النتائج كما موضح في الشكل الاتي :
ويظهر البرنامج قيم E ، كما ان هناك دليل لوني لقيم E التي على ضوئها يحدد مدى التطابق وفرز التواليات او ترتيبها. والجزء الآخر من التقرير يكون نصي يظهر فيه تعريف بالتوالي وهويته وبعض القيم الإحصائية ، وتظهر اصطفافات توالي الاستعلام وتوالي قاعدة البيانات، ويظهر التطابق بنقطتين عمودية في حين التشابه يشار اليه بنقطة واحدة ، اما عدم التطابق فيترك فارغا .
|
|
إجراء أول اختبار لدواء "ثوري" يتصدى لعدة أنواع من السرطان
|
|
|
|
|
دراسة تكشف "سببا غريبا" يعيق نمو الطيور
|
|
|
|
تطبيق حقيبة المؤمن يسجّل أكثر من (124) مليون تلاوة خلال شهر رمضان
|
|
الهيأة العليا لإحياء التراث تُصدر الكتاب الخامس من سلسلة (بحوث مختارة من مجلّة الخزانة)
|
|
قسم شؤون المعارف يصدر دليلًا خاصًّا بإصداراتِه
|
|
المجمع العلمي يكرّم المساهمين بنجاح نشاطاته القرآنية في شهر رمضان الكريم
|