يوجد عدد من المضادات الحيوية وبعض السموم التي تعمل بشكل انتقائي على تثبيط تصنيع البروتين في البكتريا، وذلك بسبب الاختلاف بين النظام الرايبوسومي في حقيقيات النواة وبدائيات النواة.

1- Aminoglycosides مثل الStreptomycin والGentamycin والAmikin والتي ترتبط مع 23S  rRNA وتعيق ارتباط الmRNA مع الرايبوسومة.

2- Tetracyclines والتي تمنع ارتباط الAminoacyl-tRNA مع الموقع A.

Chloramphenicol -3 يعمل على تثبيط الPeptidyl transferase.

4- Puromycin يمتلك تركيباً مشابهاً للـ Tyrocyl-tRNA ويسبب تحرراً للببتيد قبل نضجه في كل من حقيقيات وبدائيات النواة.

5- Cycloheximide يعمل على تثبيط إنزيم الPeptidyl transferase في حقيقيات النواة فقط.

6- السم الخارجي لبكتريا الخناق (Diphtheria exotoxin) يعمل على تثبيط وظيفة الـ ADP-ribosylates eEF2

هذا وقد تحدث تحوّرات اختلالية على مستوى التركيب الثانوي للبروتين، مؤدّية بذلك إلى حدوث بعض الأمراض الخطيرة مثل مرض جنون البقر ( الاعتلال الدماغي الاسفنجي ) .