تطور موديل الميكانيك الجزيئي تطورا سريعاً وذلك للحاجة الماسة لوصف التراكيب الجزيئية وخصائصها، حيث انه يعامل الذرات بوصفها كرات (Spheres) و الأواصر كنوابض (Springs) (Hooke’s law). ان النابض او السبرنك المشوه يستخدم رياضيا لوصف قابلية الآواصر على المط (Stretch)، الانحناء (Bend) و اللي (Twist). وان الذرات غير المتآصرة تتداخل من خلال تجاذب فان درفالز (Vander-Waals attraction)، التنافر الفراغي (Steric repulsion) والتجاذب والتنافر الالكتروستاتيكي.⁽¹⁾

ان طرق الميكانيك الجزيئي تعتمد على المبادئ الآتية:-

1. النوى والالكترونات تتمركز داخل الذرة مثل الجسيمات.
2. الاواصر بين الجسيمات تم ملاحظتها على اساس مهتزات توافقية (Harmonic Oscillators) .
3. التداخلات غير المتأصرة بين هذه الجسيمات تعامل على اساس دوال كامنة functions) (Potential مشتقة باستخدام الميكانيك الكلاسيكي .
4. الدوال الكامنة المستقلة تستخدم لوصف التداخلات المختلفة مثل طاقات (مط الاصرة والزواية المنحنية والملتوية وكذلك التداخل في الفراغ(غير المتأصرة).
5. دوال الطاقة الكامنة تعتمد على القياسات المستنتجة عمليا^ً (قيم التوزان لثوابت القوة) (Force Constants Equilibrium Values) التي تصف التداخلات بين مجاميع من الذرات.
6. مجموعة التداخلات تحسب التوزيع الخاص (Conformation) للذرة بشكل مشابه للجسيمات.
7. طاقات الميكانيك الجزيئي ليس لها معنى بوصفها كميات مطلقة فقط تستخدم لمقارنة التوتر النسبي (Steric energy) بين هيئتين او أكثر لنفس الجزيئ.

ان مجال القوة (Force filed) مثل (MM2) هو برنامج يحسب الطاقات للتراكيب مستخدما^ً الميكانيك الجزيئي. وقد تم تطويرها من قبل (N. L. Allinger) وجماعته في جامعة جورجيا ويستخدم لحساب الطاقة (E).

-------------------------------------------------------------------------------

1-A. K. Rappe and C. Caswit, “Molecular Mechanics Across Chemistry”, University Science Book, Saualito, California, (1997).