هي المعادن التي ترتفع نسبة كثافتها عن خمس غرامات لكل سنتمتر مكعب، يلعب هذا النوع من المعادن دوراً فعالاً في النظام البيئي، ويدخل في تركيب أجسام الأحياء، أمّا الجانب السلبي لهذه المعادن فهو عدم قابليتها للتحلل أو بطء تحللها ما يؤدي إلى تراكمها بكميات كبيرة في التربة ويتمثل خطرها من سميّتها ومن خاصيتها الإشعاعيّة، ومن أكثر المعادن التي تؤثّر سلباً على التربة كالرصاص والزئبق، ومن أهم المركبات الضارة للتربة: الملوثات العضوية، كالإسفلت، والمركبات الفينولية، والزيوت. الغازات السامة، وثاني أكسيد الكربون، وكبريتيد الهيدروجين، والميثان. المواد المسرطنة، والعناصر الثقيلة، والمركبات العضوية، والأسبيستوس. المعادن السامة، والزرنيخ، والزنك، والكادميوم.