إن التسلسل ثلاثي القواعد النيتروجينية على الحمض النووي الريبي الناقل tRNA الذي يطابق الشفرة الوراثية (الكودون) يُعرف بإسم Anticodon وهو يقع بشكل رئيس خارج النواة، إذ انه يرتبط بكودونات mRNA بأصرة هيدروجينية وبطريقة تكميلية من خلال التفاعل التكميلي للكودون والكودون المضاد الذي يحدث داخل الرايبوسوم، أي انه يربط تسلسل الأحماض الأمينية للبروتين بالتسلسل النيوكليوتيدي المكمل لشفرات الـmRNA أثناء عملية تخليق البروتينات، فعندما يتجمع الرايبوسوم على mRNA فإنه يجلب الحمض النووي الريبي مع مضاد كودون لقراءة الكودون على mRNA ، وهو ما يضمن إدخال الحمض الأميني المناسب في متعدد الببتيد.

إن الوظيفة الرئيسة للشفرة المضادة أو مضاد الكودون هي المساعدة في تصنيع البروتين أثناء عملية الترجمة، كما انه يسمح للبروتينات بالتطوّي وإجراء تفاعلات داخل بنيتها لإعطاء البروتين قدرته على العمل، إذ تقوم الذراع المضادة للكودون في الحمض النووي الناقل بوظيفتها أثناء الترجمة لتشكل قواعد الكودون المضاد القاعدة التكميلية عن طريق تكوين الروابط الهيدروجينية المناسبة، من خلال الاقتران مع الكودون الموجود على mRNA لنقل الحمض الأميني المناسب إلى الرايبوسوم، ليتم إضافته إلى سلسلة الببتيد (مجموعة الأحماض الأمينية).

من الممكن أن يكون لدى الإنسان 64 مضاداً للكودون يحل محل 64 كودوناً نموذجياً يشفر الأحماض الأمينية العشرين فضلاً عن شفرات البدء والتوقف في الجين الذي يشفر الجين المضاد في شريط الحمض النووي المقابل.

 يتكون كل من الكودون والكودون المضاد من المادة نفسها أي النيوكليوتيدات Nucleotides لكنهما يتكونان من أنواع مختلفة من الRNA ، فالكودون المضاد يحتوي على متواليات من قواعد تكميلية بترتيب عكسي، مثلاً: إن كودون الحمض الأميني الميثيونين هو AUG ومضاده هو CAU ، لذلك فإن نقل الميثيونين RNA سيكون التتابع CAU مضاداً له على الحمض النووي الريبي الناقل tRNA الذي سيرتبط بكودون mRNA عند الترجمة، كما انه يتم قراءة الحمض النووي (tRNA) بشكل معكوس أي من 3' إلى 5' ، فمثلاً الحمض RNA الذي يحتوي على الكودون UUU هو مكمل للكودون AAA والذي يشفر للحمض الأميني فينيل ألانين، كما ان الحمض tRNA مع الكودون المضاد CCC هو مكمل للكودون GGG الذي يشفر للحمض الأميني الكلايسين، وتعد GGA) و GGG و GGU و( GGC هي الشفرات المضادة للحمض الأميني البرولين (و ACA و (ACG للسيستين وAGU) و (ACC للتربتوفان و (UAC) الشفرة المضادة للميثيونين. انظر الشكل رقم (1).

الشكل (1) مخطط شفرة مضادة