تعد تقنية الفصل الكروماتوجرافي من أهم التقنيات المستخدمة للكشف عن المتفجرات وتحليلها، ويوجد عدة أنواع من هذه التقنية تعتمد طريقة الفصل فيها على أساس الاختلاف بين طوري الفصل المتحرك والثابت:

1. كروماتوجرافيا الطبقة الرقيقة TLC
وهي عبارة عن طريقة أولية للفصل اللوني بين المواد الكيميائية المختلفة بناء على معدل السريان وزمن المكوث لكل مادة، ويستخدم فيها طورين أحداهما ثابت ويحتوي على مادة جل السيليكا مثبتة على لوح زجاجي، وطور متحرك مغمور في مذيب عضوي مناسب للفصل .

2 .كروماتوجرافيا الغاز GC المرتبط بعدد من المقدرات.
وهي تقنية للفصل الآلي بين المواد المختلفة عن طريق استخدام طور متحرك غازي، وطور ثابت على هيئة أنابيب فصل ذات قطر وأطوال متفاوتة المواد مختلفة القطبية يتم استخدامها اعتماداً على طبيعة العينات المدروسة.

ويوضح الشكل (3-7) القمم الكروماتوجرافية لعدد من المتفجرات العضوية التي تم فصلها باستخدام الكروماتوجرافيا الغازية.

(1) http://pegasus.cc.ucf.edu

3-کروماتوجرافيا السائل ذو الأداء العالي HPLC
تعد كروماتوجرافيا الغاز GC من أفضل طرق الفصل وأسهلها ، إلا أن بعض المتفجرات لا يمكن فصلها بهذه الطريقة وبالتالي لا يمكن التعرف على العينات المجهولة فيها، لذا يلجأ الخبراء في العادة إلى استخدام تقنيات أخرى للفصل والكشف عن هذه المواد مثل: كروماتوجرافيا السائل ذي الأداء العالي High Performance Liquid Chromatography (HPLC) ، وهي تقنية تعتمد على استخدام محاليل سائلة كطور متحرك (مذيبات )، وأعمدة فصل كطور ثابت مختلفة الأطوال والقطر والقطبية.
 

ويمكن تجهيز العينات المختلفة لتحليلها بالطرق الكروماتوجرافية بنفس الطرق التي ذكرت سابقاً في 2-8 من هذا الكتاب.
وكما سبق ذكره آنفاً، فإن تقنية كروماتوجرافيا الغاز تعد واحدة من أفضل التقنيات المستخدمة لتحليل المتفجرات، ويستخدم مع هذه التقنية عدد من المقدرات التي تتميز بالانتقائية والحساسية لكل من مجاميع النترات، والنتريت، كمقدر محلل الطاقة الحرارية TEAs) Thermal Energy Analyzer)، وأيضا مقدر التأين اللهبي(Flame Ionization Detector (FID الذي يستخدم للتأكد ، ولمعرفة المكونات الجزيئية للمتفجرات. بالإضافة إلى مقدر مطياف الكتلة Mass (Spectrometry Detector (MSD ، كما يمكن استخدام تقنية كروماتوجرافيا السائل ذي الأداء العالي في تحليل عينات المتفجرات عن طريق استخدام مقدرين رئيسين هما: مقدر الأشعة فوق البنفسجية UV، ومقدر الضوء المرئي visible والتي يمكنها الكشف عن عينات المتفجرات في المجال المرئي وفوق البنفسجي . كما يمكن الاستفادة من تقنية الكروماتوجرافيا الأيونية (Ion Chroma tography (IC في تحليل عينات المتفجرات، وذلك لقدرتها في الكشف على كل من الأيونات التالية:

النترات ^-₃ NO، والنيتريت₂ NO ، والأمونيوم ⁺ ₄ NH، والسولفنك SO₃H وأحادي ميثيل الأمين ₃ N^-CH ، وفوق الكلورات^-₄ ClO ، والبوتاسيوم K والكلورين Cl.
إلا أن هذه التقنية قليلة الانتشار في المعامل والمختبرات الجنائية في الوقت الحالي، حيث حلت طرق الانتقال الكهربي الشعيري محلها للكشف عن الأيونات في بقايا المتفجرات، والتي تتميز بأنها لا تحتاج إلى أجهزة معقدة عند الكشف عن المتفجرات.