إتصل بنا

ENGLISH

بحث في العناوين     بحث في المحتوى     بحث في اسماء الكتب     بحث في اسماء المؤلفين

القرأن الكريم وعلومه
العقائد الأسلامية
الفقه الأسلامي
علم الرجال
السيرة النبوية
الاخلاق والادعية
اللغة العربية وعلومها
الأدب العربي
الأسرة والمجتمع
التاريخ
الأدارة والاقتصاد
علم الفيزياء
علم الكيمياء
علم الأحياء
الرياضيات
الزراعة
الجغرافية
القانون
الإعلام

رمز الامان : 5672

علم الاحياء

عدد المواضيع في هذا القسم 9508
تاريخ علم الأحياء وعلمائه
النبات
الحيوان
الأحياء المجهرية
علم الأمراض
الحشرات
التقانة الإحيائية
التقنية الحياتية النانوية
اللقاحات
البيئة والتلوث
علم الأجنة
الأحياء الجزيئي
علم وظائف الأعضاء
المضادات الحيوية
علم الخلية
الوراثة
الأحياء العامة
المناعة
التحليلات المرضية
الانزيمات

SHM Is Mediated by AID, Ung, Elements of the Mismatch DNA Repair Machinery, and Translesion DNA Synthesis Polymerases

01:22 AM

30 / 4 / 2021

47

Author : JOCELYN E. KREBS, ELLIOTT S. GOLDSTEIN and STEPHEN T. KILPATRICK

Book or Source : LEWIN’S GENES XII

page :

+
-

SHM Is Mediated by AID, Ung, Elements of the Mismatch DNA Repair Machinery, and Translesion DNA Synthesis Polymerases


KEY CONCEPTS
- Somatic hypermutation (SHM) uses some of the same critical elements of class switch recombination (CSR).Like CSR, SHM requires activation-induced deaminase (AID).
- Ung intervention influences the pattern of somatic
mutations.
- Elements of the mismatch repair (MMR) pathway and TLS DNA polymerases are involved in SHM and CSR.

The deamination or removal of a deoxycytosine base leads to insertion of somatic mutation(s) in different ways (FIGURE 1). When AID deaminates a deoxycytosine, it gives rise to deoxyuridine. This is not germane to DNA and can be dealt with by the B cell in different ways. The deoxyuridine can be “replicated over”; it will pair with deoxyadenine during replication. The emerging mutation is an obligatory dC → dT transition and dG →dA transition on the complementary strand. The net result is the replacement of the original dC-dG pair with a dT-dA pair in half of the progeny cells. Alternatively, the deoxyuridine can be removed from DNA by Ung to give rise to an abasic site. Indeed, the key event in generating a random spectrum of mutations is the creation of an abasic site. This can be replicated over by an error-prone TLS DNA polymerase, such as polymerase ζ, polymerase η, or polymerase θ, which can insert all three possible mismatches (mutations) across the abasic site . In another mechanism, the dU-dG mispair recruits the MMR machinery, starting with Msh2/Msh6, to excise the stretch of DNA containing the damage, thereby creating a gap that needs to be filled in by resynthesis of the missing DNA strand (see the section Controlling the Direction of Mismatch Repair in the Repair Systems chapter). This resynthesis is carried out by an error-prone TLS polymerase, which will introduce mutations. What restricts the activity of the SHM machinery to only target V(D)J regions is still unknown. Ung can be blocked by introducing into cells the bacteriophage PSB-2 gene encoding the uracil-DNA glycosylase inhibitor (UGI) protein. When the UGI gene is expressed in a lymphocyte cell line or Ung is knocked out, the pattern of mutations changes dramatically, with almost all mutations from dC-dG pairs comprising the predicted transition from dC-dG to dA-dT.


FIGURE 1. Deamination of C by AID gives rise to a U-G mispair. U can be replicated over, resulting in C-G to A-T transitions in 50% of progeny B cells. When the action of cytidine deaminase (top) is followed by that of uracil-DNA glycosylase, an abasic site is created. Replication past this site should insert all four bases at random into the daughter strand (center). If the uracil is not removed from the DNA, its replication gives rise to a C-G to T-A transition. Alternatively, the U-G mispair is recognized by the MMR machinery, which excises DNA containing the mismatch and then fills in the resulting gap using an error-prone DNA polymerase.
 This will lead to insertion of further mismatches (mutations).
The main difference between CSR and SHM is the nature of DNA lesions underpinning the two processes. DSBs are introduced as obligatory intermediates in CSR, whereas individual point mutations are introduced as events of single-strand cleavages in SHM. AID and/or DNA repair factor(s) also function as scaffolds to assemble different protein complexes in CSR and SHM. Thus, AID and DNA repair factors contribute to these processes through both enzymatic and nonenzymatic functions, possibly in different ways.
AID plays a central role in both CSR and SHM. However, whereas Ung intervention is a central event in CSR, it is not necessarily in SHM, and TLS polymerases play a greater role in SHM than CSR.

ثِـــــــمَارُ الأَسفَـــــــــار .. أَقَلُّ مَا يَلْزَمُكُمْ لله أَلاَّ تَسْتَعيِنُوا بِنِعَمِهِ عَلَى مَعَاصِيهِ

ثِـــــــمَارُ الأَسفَـــــــــار .. افْعَلُوا الْخَيْرَ وَلاَ تَحْقِرُوا مِنْهُ شَيْئاً

ثِـــــــمَارُ الأَسفَـــــــــار ..عقيدَتُنا في المَعادِ الجِسمانيِّ

ثِـــــــمَارُ الأَسفَـــــــــار .. أَفْضَلُ الزُّهْدِ إِخْفَاءُ الزُّهْدِ

مظاهر التطرف الاجتماعي

جدلية تأثُرْ النحو العربي بالمنطق والفلسفة

صندوق المستقبل

ثِـــــــمَارُ الأَسفَـــــــــار .. أَفْضَلُ الْأَعْمَالِ مَا أَكْرَهْتَ نَفْسَكَ عَلَيْهِ

أوغسطينوس العظيم .. الضال الذي أوصلته محطات الانحراف إلى الله!!

ما هو مقام المتقين يوم القيامة ؟

دعاءُ يوم الجمعة

دُعاء يوم الخميس

في معنى قوله تعالى { إِنَّمَا أَمْوَالُكُمْ وَأَوْلَادُكُمْ فِتْنَةٌ}

القصص القرآني خلاصة التجربة الإنسانية للسابقين

من الآراء الفقهية التي لا تمت الى العلم والتشريع بصلة!!

المريض بعين الله تعالى(من كرامة المؤمن على الله)

متى ترث البنت بالفرض وبالقرابة معاً ؟

الوراثة والبيئة وأثرهما على سعادة الفرد وشقائه

تدَخُّلُ الوالدينِ في الاختيارِ وتناقُضُ القناعاتِ

كيف َتكون علاقَتُكِ مع حَمَاتِكِ – أُمُّ زَوجِكِ – صافيةً ومُستَقِرَّةً؟

ماذا يجِبُ على مُعَلِّمَةِ الرَّوضَةِ أنْ تَعرِفَهُ؟

لماذا فُرِضَ الحِجابُ على المرأةِ؟

أدوارُ المرأةِ النّاجِحَة

ماهِيَ أُصولُ التربيةِ الإسلاميةِ؟

ماهِيَ أَهَمُّ مُشكِلَةٍ يواجِهُها الوالدانِ؟

حَفِّزْ طفلَكَ ليُبادِرَ الى اختيارِهِ

متى تكونُ الأسرَةُ مُنسَجِمةً؟

Civic الأسطورية من هوندا أصبحت أكبر وأكثر جاذبية!

Amazon توسّع منافستها لآبل بأجهزة ذكية مميّزة

ثغرة في شرائح Qualcomm تهدد هواتف أندرويد حول العالم!

قشور البرتقال للحصول على خشب شفاف

العثور على جمجمة لثور قديم عمره 10 آلاف عام جنوب سيبيريا

باحثون يرصدون تفاعلات نووية جديدة في تابوت مفاعل تشيرنوبيل ويحذرون من كارثة

مركبة أخرى من هيونداي لمحبي التميّز والقوة والتصاميم العصرية

تويوتا تعلن عن أحدث سياراتها العائلية الأنيقة والعملية

ميزة طال انتظارها ستظهر في تليغرام قريبا

اكتشافها قد ينقذ حياتك .. قائمة كاملة بأعراض النوبة القلبية ينبغي أن تكون على دراية بها!

تقوي المناعة وتقي من الأمراض... 10 أطعمة احرص عليها في سن الأربعين

يمكنك تناول هذه الأطعمة في الليل دون ضرر

خبراء: ماذا يحدث لجسمك إذا تناولت المعكرونة يوميا؟

كيف يؤثر عدم تناول الفطور على الصحة

أخصائية روسية تكشف عن الأشخاص الممنوعين من تناول البصل

عشق القهوة قد تحكمه عوامل جينية

فوائد تناول التمر بانتظام

طبيبة روسية تكشف عن المواد الغذائية المساعدة للهضم

زكاةُ الفطرة: مقدارُها.. ولمَنْ تُعطى.. بحسب مكتب المرجع الدينيّ الأعلى

مزارُ السيدة زينب الصغرى أحد المحطّات الرمضانيّة لقسم الشؤون الدينيّة

العتبة العلوية توزع وجبات الإفطار للمصابين بوباء كورونا والعاملين على رعايتهم

مركز القرآن الكريم في العتبة العلوية يقيم ندوة علمية بعنوان (مصحف جامعة كامبريدج رقم (1125) - دراسة تحليلية)

بالصور: التائبون العابدون الساجدون.. أجواء ايمانية خاصة عند مرقد الامام الحسين (ع) خلال شهر رمضان

بهدف توفير الخدمات والراحة النفسية للمواطنين والزائرين.. كوادر العتبة الحسينية تباشر بتأهيل أحد اهم الشوارع المؤدية الى مرقد الامام الحسين (ع)

الأمانة العامة للعتبة الكاظمية المقدسة تباشر بمشروع مظلات صحن باب المراد

وفد معهد القرآن الكريم في العتبة العباسية المقدسة يشارك في المحفل القرآني الرمضاني للعتبة الكاظمية المقدسة

العتبة العسكرية المقدسة توزع وجبة جديدة من السلات الغذائية الرمضانية للعوائل المتعففة من أهالي سامراء