إتصل بنا

ENGLISH

بحث في العناوين     بحث في المحتوى     بحث في اسماء الكتب     بحث في اسماء المؤلفين

القرأن الكريم وعلومه
العقائد الأسلامية
الفقه الأسلامي
علم الرجال
السيرة النبوية
الاخلاق والادعية
اللغة العربية وعلومها
الأدب العربي
الأسرة والمجتمع
التاريخ
الأدارة والاقتصاد
علم الفيزياء
علم الكيمياء
علم الأحياء
الرياضيات
الزراعة
الجغرافية
القانون
الإعلام

رمز الامان : 9351

علم الاحياء

عدد المواضيع في هذا القسم 9430
تاريخ علم الأحياء وعلمائه
النبات
الحيوان
الأحياء المجهرية
علم الأمراض
الحشرات
التقانة الإحيائية
التقنية الحياتية النانوية
اللقاحات
البيئة والتلوث
علم الأجنة
الأحياء الجزيئي
علم وظائف الأعضاء
المضادات الحيوية
علم الخلية
الوراثة
الأحياء العامة
المناعة
التحليلات المرضية
الانزيمات

Okazaki Fragments Are Linked by Ligase

11:40 AM

6 / 4 / 2021

32

Author : JOCELYN E. KREBS, ELLIOTT S. GOLDSTEIN and STEPHEN T. KILPATRICK

Book or Source : LEWIN’S GENES XII

page :

+
-

Okazaki Fragments Are Linked by Ligase


KEY CONCEPTS
- Each Okazaki fragment begins with a primer and stops before the next fragment.
- DNA polymerase I removes the primer and replaces it with DNA.
- DNA ligase makes the bond that connects the 3′ end of one Okazaki fragment to the 5′ beginning of the next fragment.

Researchers can now expand their view of the actions involved in joining Okazaki fragments, as illustrated in FIGURE 1. The complete order of events is uncertain, but it must involve synthesis of RNA primer, its extension with DNA, removal of the RNA primer, its replacement by a stretch of DNA, and the covalent linking of adjacent Okazaki fragments.


FIGURE 1. Synthesis of Okazaki fragments requires priming, extension, removal of RNA primer, gap filling, and nick ligation.
Synthesis of an Okazaki fragment terminates just before the beginning of the RNA primer of the preceding fragment. When the primer is removed, there will be a gap. The gap is filled by DNA polymerase I; polA mutants fail to join their Okazaki fragments properly. The 5′–3′ exonuclease activity removes the RNA primer while simultaneously replacing it with a DNA sequence extended from the 3′–OH end of the next Okazaki fragment. This is equivalent to nick translation, except that the new DNA replaces a stretch of RNA rather than a segment of DNA.
In mammalian systems (where the DNA polymerase does not have a 5′–3′ exonuclease activity), Okazaki fragments are connected by a two-step process. Synthesis of an Okazaki fragment displaces the RNA primer of the preceding fragment in the form of a “flap.” FIGURE 2 shows that the base of the flap is cleaved by the enzyme FEN1 (flap endonuclease 1). In this reaction, FEN1 functions as an endonuclease, but it also has a 5′–3′ exonuclease activity. In DNA repair reactions, FEN1 can cleave next to a displaced nucleotide and then use its exonuclease activity to remove adjacent material.


FIGURE 2. FEN1 is an exo-/endonuclease that recognizes the structure created when one strand of DNA is displaced from a duplex as a “flap.” In replication it cleaves at the base of the flap to remove the RNA primer.
Failure to remove a flap rapidly can have important consequences in regions of repeated sequences. Direct repeats can be displaced and misaligned with the template; palindromic sequences can form hairpins. These structures can change the number of repeats . The general importanceof FEN1 is th at it prevents flaps of DNA from generating structures that can cause deletions or duplications in the genome.
After the RNA has been removed and replaced, the adjacent Okazaki fragments must be linked together. The 3′–OH end of one fragment is adjacent to the 5′–phosphate end of the previous fragment. The enzyme DNA ligase makes a bond by using a complex with AMP. FIGURE 3. shows that the AMP of the enzyme complex becomes attached to the 5′ phosphate of the nick and then a phosphodiester bond is formed with the 3′–OH terminus of the nick, releasing the enzyme and the AMP. Ligases are present in both prokaryotes and eukaryotes.

FIGURE 3. DNA ligase seals nicks between adjacent nucleotides by employing an enzyme–AMP intermediate.
The E. coli and Φ T4 ligases share the property of sealing nicks that have 3′–OH and 5′–phosphate termini, as illustrated in Figure 3. Both enzymes undertake a two-step reaction that involves an enzyme–AMP complex. (The E. coli and T4 enzymes use different cofactors. The E. coli enzyme uses nicotinamide adenine dinucleotide [NAD] as a cofactor, whereas the T4 enzyme uses ATP.) The AMP of the enzyme complex becomes attached to the 5′ phosphate of the nick, and then a phosphodiester bond is formed with the 3′–OH terminus of the nick, releasing the enzyme and theAMP.

ثِـــــــمَارُ الأَسفَـــــــــار .. أَفْضَلُ الْأَعْمَالِ مَا أَكْرَهْتَ نَفْسَكَ عَلَيْهِ

أوغسطينوس العظيم .. الضال الذي أوصلته محطات الانحراف إلى الله!!

ثِـــــــمَارُ الأَسفَـــــــــار .. عقيدتنا في عصمة الإمام

 ثِـــــــمَارُ الأَسفَـــــــــار ..عقيدَتُنا في حَقِّ المُسلِمِ على المُسلِم

ثِـــــــمَارُ الأَسفَـــــــــار .. عقيدَتُنا في البَعثِ والمَعاد

ثِـــــــمَارُ الأَسفَـــــــــار .. عقيدَتُنا في الدَّعوةِ إلى الوَحدَةِ الإسلاميّة

ثِـــــــمَارُ الأَسفَـــــــــار ..عقيدَتُنا في التّعاوُنِ معَ الظالمينَ

مراسيم ولادة الإمام الحسين (عليه السلام)

المَبعَثُ النّبويُّ الشّريفُ

المسلم مسؤول عن حلّية عمله

هلاك المتوكل العباسي بدعاء الإمام الهادي (عليه السلام)

ما الحكمة الإلهية من تأخير عقوبة المسئ في الدنيا؟

مكافحة المخدرات مسؤولية مجتمعية

لماذا لُقّب المتوكل العباسي بـ مُحيّ السنة ومميت البدعة؟

المريض بعين الله تعالى،الحلقة الاولى (ثواب من اصيب بالحمى)

سرعة إنزال العقاب بالجاني ترسخ العدل وتطفئ نار الجريمة

معاقبة الجاني بين القيم القرآنية والعادات الجاهلية

مَن هُوَ أخوكَ مِن بينِ أصدقائك؟

ماذا يجِبُ على مُعَلِّمَةِ الرَّوضَةِ أنْ تَعرِفَهُ؟

لماذا فُرِضَ الحِجابُ على المرأةِ؟

أدوارُ المرأةِ النّاجِحَة

ماهِيَ أُصولُ التربيةِ الإسلاميةِ؟

ماهِيَ أَهَمُّ مُشكِلَةٍ يواجِهُها الوالدانِ؟

حَفِّزْ طفلَكَ ليُبادِرَ الى اختيارِهِ

متى تكونُ الأسرَةُ مُنسَجِمةً؟

زينَةُ الجوهَرِ وزينَةُ المظهَرِ

الفتاةُ المُراهِقَةُ بينَ الرُّشدِ والتَّمَرُّد

بعد محاولات للتكاثر استمرت 20 عاما… ولادة شبل نمر أبيض نادر و3 أشبال بنغالية أخرى

أكبر الديناصورات الآكلة للحوم... دراسة تكشف أعداد ديناصور تي ركس التي عاشت على الكوكب

للمرة الأولى في التاريخ.. مروحية ناسا الصغيرة في سماء المريخ قريباً

منافِسة صينية رخيصة الثمن لسيارات كيا وهيونداي تظهر قريبا

سيارة A3 الشبابية من أودي تصل أسواقا جديدة

مايكروسوفت تتحدى آبل بحواسب محمولة متطوّرة وأنيقة

ببطارية كبيرة ومواصفات منافسة.. نوكيا تعلن عن هاتف رخيص الثمن

علماء سييبريا يبتكرون تكنولوجيا إنماء المواد شبه الموصلة في الفضاء

اكتشاف يجعل الأشياء غير مرئية بإنشاء موجات ضوية خاصة تخترق المواد غير الشفافة

أمريكا تخصص 1.7 مليار دولار لمكافحة سلالات كورونا الجديدة

دراسة سعودية: قلبك قد يكون في خطر حال افتقارك لهذا الفيتامين

الفطر السحري دواء فعال لمعالجة الاكتئاب!

إحساسنا الدائم بالجوع قد يدلل على مرض خطير!

مشروب الشفاء... 5 أسباب تدفعك لشربه

دراسة تحذر: هذا ما يفعله الدايت في هرمون الذكورة

تحذير... أدوية وعقاقير تسبب مشاكل في الرؤية والنظر

طبيبة روسية تحذر من الخطر القاتل للإفراط في شرب المياه

علماء يحذرون من مادة كيميائية في المنظفات تصيب بالسرطان وباركنسون

معهدُ القرآن الكريم: بغداد تحتضن (30) ختمةً قرآنيّة رمضانيّة بكرخها ورصافتها

دعوةٌ للباحثين والمختصّين للمشاركة في مشروع (جوهر الغرب)

العتبة العلوية المقدسة تستذكر ذكرى وفاة مؤمن قريش عمّ النبي الكريم أبي طالب ( عليه السلام)

قسم الشؤون الدينية في العتبة العلوية المقدسة يطلق المسابقة العلوية العالمية الأولى 2021م

مركز تابع للعتبة الحسينية يعلن عن جاهزيته لإقامة مؤتمر عالمي خاص بزيارة الاربعين

مع حلول شهر رمضان المبارك.. سِلال غذائية من مرقد الامام الحسين (ع) للعوائل المتعففة وذوي الشهداء في (6) محافظات عراقية

أجواء الصحن الكاظمي الشريف تزدان بإقامة الختمة القرآنية الرمضانية المرتلة

مع إطلالة شهر رمضان المبارك العتبة الكاظمية المقدسة تنظّم مَحفلها القرآني اليومي

الامين العام للعتبة العسكرية المقدسة يترأس الاجتماع الدوري لرؤساء ومعاوني اقسام العتبة المقدسة