يبلغ المكون الحيوي للتربة Biological component of the soil حوالي 0.2% من وزن التربة وهو يحتوي علي جذور النباتات الحية والأعداد الكبيرة من الأشكال الحيوانية بالتربة  Soil faunaمثل البروتوزوا والحشرات والديدان الأرضية وكذلك الكائنات الحية الدقيقة النباتية Soil microflora مثل الفطريات والأكتينومايستيات والبكتريا والطحالب.

وتقوم هذه الكائنات الحية بدور كبير في إنحلال المواد العضوية والعديد من التفاعلات الحيوية المفيدة لخصوبة التربة. ولكن في الأراضي المتأثرة بالأملاح أو الأراضي الغدقة فإن بعض الكائنات الحية التي تقوم بدور مفيد يحل محلها كائنات أخري ضارة . ومن الأمثلة علي ذلك أنه بدلاً من بكتيريا التأزت Nitrifying Bacteria وبكتيريا تثبيت الأزوت Nitrogen fixers تنشط بكتريا التعفن وبكتريا إختزال الأزوت والتي تعمل علي تطايره فتفقد التربة ما بها من الأزوت.ويلاحظ أنه بعد التخلص من الأملاح الذائبة بالتربة بالغسيل لا تسترد التربة خصوبتها دفعة واحدة ولكنها تستعيد هذه الخصوبة بالتدريج مع تكاثر هذه الكائنات.

وقد أوضح Lipman and Foxler أن ضرر أملاح الكربونات علي نشاط بكتيريا التأزت كان أكثر من ضرر الكلوريدات وكان أقل الأضرار يرجع إلي أملاح الكبريتات وكان التأثير علي بكتيريا تثبيت الأزوت  Nitrogen fixing bacteria في النباتات البقولية أقل من التأثير علي بكتيريا التأزت . أما بكتيريا النشدرة Ammonifing bacteria فقد وجد أن تأثير الأملاح علي نشاطها يرجع ألي أن البكتيريا تنتقل إلى دور الكمون في الوسط الملحي ثم تعود إلى نشاطها ثانية عند التخلص من الأملاح.

وعلي سبيل المثال وجد أن كربونات الصوديوم ذات تركيز 100جزء في المليون تعتبر سامة جداً لبكتيريا التأزت بينما كلوريد الصوديوم ساما جدا لها عندما يكون تركيزه 1000جزء في المليون. ودلت نتائج تجارب Greaves, Cater and Goldthrope  أن التركيزات القليلة جدا من كلوريد الصوديوم يساعد علي تكاثر ونشاط البكتريا في التربة. أما التركيزات بين 2500 إلى 5000 جزء في المليون من ملح كبريتات الصوديوم فيتسبب عنه ضررا بليغا للبكتريا.

وقد لوحظ  أن بكتريا أكسدة الكبريت Sulfure oxidizing bacteria  لا تتأثر في وجود كلوريد أو كبريتات الصوديوم.

وتتأثر بكتريا إنحلال السليلوز الهوائيةAerobic Cellulose decomposing bacteria في وجود كلورور الصوديوم في الوسط الذي تعيش وتنمو فيه.

وتدل العديد من البحوث والدراسات علي أن الأملاح تؤثرا تأثيرا سيئا في إنحلال المادة العضوية التي توجد أصلا في الأرض Native soil organic matter  بالإضافة لأثرها السيئ علي إنحلال المادة العضوية التي تضاف للأرض   Added organic matter في صورة بقايا نباتية أو أسمدة عضوية أخري. وتؤثر الأملاح علي نشاط أو فاعلية الأنزيمات Activity of enzymes التي تنتجها الكائنات الحية المختلفة في التربة للقيام بالتفاعلات الحيوية المختصة المتعلقة بالمادة العضوية. وبعض الأملاح يثبط Inhibit (وقد يمنع) هذه الأنزيمات من القيام بنشاطها بمعدله الطبيعي وقد يقوم البعض الأخر بتنشيط Activate هذه الأنزيمات . ويتوقف معدل التثبيط علي  نوع وتركيز الأملاح في التربة.

وقد استنتج أن طبيعة التربة ومقدار ما بها من رطوبة لها تأثير علي مدي الأضرار التي تلحق بهذه الكائنات الحية ، فمثلا يزداد الضرر في الأراضي الرملية عنها في الأراضي الطينية ويقل الضرر كلما تقل درجة الرطوبة بالتربة.

ويمكن تفسير الأثر الضار للأملاح علي الكائنات  الحية الدقيقة بأنه يرجع إلى حدوث تغيرات كيميائية-طبيعية Physicochemical changes   في بروتوبلازم خلايا الكائن الحي نتيجة دخول الأملاح وتكوين بروتين صودي أوكالسي أو غيره (تبعاً لنوع الملح) مما يجعل نشاط البروتوبلازم غير طبيعي.

وقد لوحظ في مستخلص تربة قلوية تحت الاستصلاح ما يلي:

1- تتزايد الأعداد الكلية للكائنات الحية الدقيقة بالتربة Total count of soil microorganisms بإضافة الجبس أو الكبريت.

2- أعداد Streptomyces (وهو أحد أجناس الأكتينوماسيتات) والتي كانت توجد بأعدادعالية قبل الاستصلاح انخفضت أعدادها بالاستصلاح وإضافة الجبس.

3- الميكروبات القادرة علي تكوين جراثيم Spore forming microorganisms إنخفضت أعدادها الجبس تزايدت أعدادها.

4- توجد سلالات من الأزوتوباكتر Azotobacter بأعداد كبيرة في الأرض القلوية وبإضافة الجبس تزايدت أعدادها.

5- بكتريا الكلوستريديم  Clostridium التي كانت توجد بأعداد كبيرة (ولو أنها اقل من الأزوتوباكتر) تناقصت أعدادها بإضافة الجبس.

6- ميكروبات التأزت Nitrifires  التي كانت توجد بأعداد قليلة تزايدت أعدادها بوضوح بإضافة الجبس.

7- الميكروبات المحللة للسيلولوز Cellulose decomposers تزايدت أعدادها بإضافة الجبس أو الكبريت.

8- معدل إنحلال المادة العضوية Rate of organic matter decomposition تناقص بزيادة تركيز الأملاح في التربة.

9- تختلف درجة تأثير تكوين العقد الجذرية Formation of nodules بالنباتات البقولية بإزدياد تركيز الأملاح في التربة تبعاً لنوع المحصول البقولي وتركيز ونوع الملح السائد.

10- التركيزات المنخفضة من الأملاح قد تنشط عملية النشدرةAmmonification  نوعاً ما إلا أن الميكروبات الخاصة بعملية التأزت Nitrification تكون أكثر حساسية للأملاح من ميكروبات النشدرة.